Intenté toda la tarde con diversos tutoriales, incluso dejé actualizando fedora (780MB) durante la noche para encontrar que seguía sin poder habilitar los efectos de escritorio.
Cuando abría una terminal y tecleaba:

desktop-effects

Después de activarlos me aparecia un error como este:


compiz (core) - Fatal: glXCreateContext failed

Después de muchas modificaciones a mi archivo xorg.conf, lo que hice fue instalar el driver directamente de la página de nVidia.

Elegí el archivo Linux AMD64/EM64T 171.06 (Fecha: 07.03.2008), porque instalé la versión x86_64 de Fedora y me pareció que esa era la correcta.
Antes de ejecutar el script, es necesario instalar unos paquetes para que pueda compilar el driver:

yum install gcc kernel-devel

Inicie en modo root con

su -

desde un terminal.
Como para instalar el driver necesitas salirte del modo gráfico teclee:

init 4

Y ahora si a ejecutar el script.
Después de responder unas preguntas, e iniciar en modo gráfico con

startx

y eso es todo